Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SrprbP47758 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SrprbP47758 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms