Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capza1P47753 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capza1P47753 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capza1P47753 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capza1P47753 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms