Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf1P46099 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klf1P46099 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms