Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgavP43406 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgavP43406 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms