Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms