Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nkx2-5P42582 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nkx2-5P42582 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms