Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sept1P42209 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms