Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtbP41155 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtbP41155 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtbP41155 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms