Protein–RNA interactions for Protein: P35802

Gpm6a, Neuronal membrane glycoprotein M6-a, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpm6aP35802 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpm6aP35802 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gpm6aP35802 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms