Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6fP35460 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms