Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab23P35288 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms