Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Apoc3P33622 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc3P33622 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms