Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxc5P32043 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxc5P32043 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms