Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Msr1P30204 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Msr1P30204 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msr1P30204 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms