Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col2a1P28481 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col2a1P28481 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col2a1P28481 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms