Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Hoxd10P28359 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Hoxd10P28359 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Hoxd10P28359 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Hoxd10P28359 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd10P28359 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Hoxd10P28359 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd10P28359 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Hoxd10P28359 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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