Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjb1P28230 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb1P28230 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb1P28230 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms