Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjc1P28229 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjc1P28229 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms