Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-DMaP28078 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms