Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CenpbP27790 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpbP27790 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpbP27790 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms