Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd7P26516 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms