Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccnd1P25322 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms