Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd11P23813 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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