Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PparaP23204 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PparaP23204 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PparaP23204 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PparaP23204 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PparaP23204 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PparaP23204 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PparaP23204 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PparaP23204 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PparaP23204 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PparaP23204 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PparaP23204 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms