Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BdnfP21237 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BdnfP21237 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BdnfP21237 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms