Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim1P20664 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim1P20664 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim1P20664 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms