Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ms4a2P20490 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a2P20490 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms