Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P18533 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P18533 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P18533 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P18533 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P18533 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P18533 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P18533 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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