Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd48P18181 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd48P18181 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms