Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxb1P17919 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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