Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra6P16305 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms