Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ca3P16015 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ca3P16015 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms