Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FosbP13346 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FosbP13346 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FosbP13346 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FosbP13346 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FosbP13346 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FosbP13346 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FosbP13346 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FosbP13346 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms