Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scd2P13011 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scd2P13011 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms