Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcl1P12850 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl1P12850 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcl1P12850 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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