Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itga5P11688 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga5P11688 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms