Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd1d1P11609 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms