Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa1P11477 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defa1P11477 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms