Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tnp2P11378 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Tnp2P11378 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnp2P11378 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms