Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cxcl2P10889 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cxcl2P10889 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cxcl2P10889 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms