Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb4P10284 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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