Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Amd1P0DMN7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Amd1P0DMN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms