Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxc9P09633 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxc9P09633 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxc9P09633 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms