Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtaP09225 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtaP09225 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtaP09225 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtaP09225 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtaP09225 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtaP09225 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LtaP09225 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LtaP09225 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtaP09225 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtaP09225 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms