Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb5P09079 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxb5P09079 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxb5P09079 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxb5P09079 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxb5P09079 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxb5P09079 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb5P09079 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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