Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefmP08553 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefmP08553 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NefmP08553 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NefmP08553 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NefmP08553 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NefmP08553 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NefmP08553 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefmP08553 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefmP08553 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefmP08553 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefmP08553 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefmP08553 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefmP08553 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms