Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp1P08042 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp1P08042 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms