Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csf1P07141 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csf1P07141 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csf1P07141 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms