Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06344 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06344 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06344 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06344 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06344 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06344 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06344 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06344 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms