Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-Eb1P04230 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb1P04230 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms